A história passa-se na Floresta Okoya, um paraíso Pokémon protegido por regras rígidas que proíbem estranhos de entrar. O filme é centrado em Coco, um menino que foi criado por um Pokémon, tratando o Pokémon Mítico Zarude como seu pai. Ash e Pikachu encontram Coco durante uma aventura. O filme foca no tema de um “humano criado por Pokémon”, em vez do foco dos filmes anteriores no “vínculo entre um treinador humano e seus Pokémon”.