Ash, Pikachu e os seus amigos encontram um Pokémon misterioso chamado Hoopa, que possui o poder de convocar o que deseja através de anéis mágicos. Descobrem que Hoopa vive com uma família que cuida dele após um incidente no passado, quando a sua forma descontrolada, conhecida como Hoopa Desatado, causou destruição ao utilizar os seus poderes para invocar Pokémon lendários numa batalha épica. Um artefato conhecido como a Garrafa da Prisão, que prende o lado sombrio de Hoopa, é acidentalmente aberto, permitindo que Hoopa se transforme novamente na sua forma descontrolada. Desencadeia uma batalha impressionante, pois Hoopa invoca diversos Pokémon lendários, incluindo Groudon, Kyogre e Lugia, enquanto tenta provar o seu poder. Em resposta, os outros Pokémon lendários, como Dialga, Palkia, Latios e Latias, se juntam ao confronto para proteger a cidade.

Ash e os seus amigos trabalham ao lado da versão amistosa de Hoopa para conter a sua forma descontrolada e restaurar a paz.